故事背景為“靈禍”頻發、陰陽師活躍于世的現代，16歲高中生土御門春虎（石川界人 配音）生于陰陽師世家土御門，雖為名門子嗣，他運氣極差，且毫無天賦，自認為不適合成為陰陽師，和好友冬兒（木村良平 配音）無所事事度過每一天。他的青梅竹馬土御門夏目（花澤香菜 配音）則是土御門下一代當家，她天賦異稟，認真負責，有著極高的擔當繼承人守護家族的覺悟。時值暑假，夏目自東京歸來。不久，“十二神將”之一、被稱為“神童”的大連寺鈴鹿引發了“泰山府君祭”事件。在混亂戰斗中，春虎失去了親友北斗，痛定思痛的他決定成為夏目的式神，重返陰陽師之路。